地區(qū):
網(wǎng)絡(luò)
年份:
2013
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革命性的第三代測序 ---全長轉(zhuǎn)錄組,微生物基因組,基因組de novo 第三代基因測序技術(shù)又被為 “Single Molecule Real Time (SMRTTM) DNA Sequencing”(單分子實時DNA測序技術(shù)),該方法基于納米孔的單分子讀取技術(shù),不需要擴增即可快速讀取序列。目前,Pacific Biosciences 公司已經(jīng)成功推出了商業(yè)化的第三代測序儀PacBio RS平臺,使得第三代測序正式走入人們的視角。 技術(shù)優(yōu)勢: ? 更長的測序讀長 (平均讀長可超過10000 bp,有超過50%的讀長大于14000 bp),可大幅提高定位準確性及拼接效率,有利于闡釋基因組所發(fā)生的變異以及大尺度結(jié)構(gòu)重排等信息并發(fā)現(xiàn)其相關(guān)的生物學意義。? 單分子實時檢測,模板制備時無需PCR擴增,每一條模板鏈都可獲得相應序列信息,數(shù)據(jù)覆蓋均勻,準確;可以檢測稀有變異;? 可同時獲得動力學信息,可進行甲基化等修飾堿基的直接測定;? 覆蓋深度幾乎不受序列中GC/AT含量差異的影響;? 從樣本制備到獲取序列信息簡便快捷; 參考文獻Donald S, Hagen T, Fabian G, et al. A single-molecule long-read survey of the human transcriptome [J]. Nature biotechnology, 2013.Flusberg B A, Webster D R, Lee J H, , et al. Direct detection of DNA methylation during single-molecule,real-time sequencing [J]. Nat Method, 2010.Chin C...